Есть много программ для создания стереоизображений из стереопар. Я пользуюсь 3DGugleFREE. При довольно убогом дизайне это вполне вменяемая и удобная программа. Есть все необходимые инструменты, такие как смещение вправо-влево, вверх-вниз, поворот изображения, масштабирование одного кадра (тоже очень удобно, особенно при макросъёмке, где очень трудно выдержать одинаковое расстояние до объекта при перемещении камеры). Подкупает огромное рабочее поле - на весь экран (инструменты вынесены на отдельную панель с режимом "поверх всех окон"), великолепное масштабирование. Если не знаете что выбрать, то настоятельно рекомендую.
3DGugleFREE скачать бесплатно можно
тут 
